影響染色的其他因素，還有菌體細胞的構(gòu)造和其外膜的通透性，如細胞膜的通透性、膜孔的大小和細胞結(jié)構(gòu)完整與否，在染色上都起一定作用。此外，培養(yǎng)基的組成、菌齡、染色液中的電介質(zhì)含量和pH、溫度、藥物的作用等，也都能影響細菌的染色，所以我們在染色時要注意當染色結(jié)果與預(yù)想的結(jié)果出現(xiàn)不一致時，要考慮到這些因素的影響。
轉(zhuǎn)化活性是檢測質(zhì)粒生物活性的重要指標，在基因克隆技術(shù)中，轉(zhuǎn)化（transformation）是特指以質(zhì)粒 DNA 或以它為載體構(gòu)建的重組質(zhì)粒 DNA（包括人工染色體）導(dǎo)入細胞的過程， 是一種常用的基本實驗技術(shù)。
酸堿指示劑一般是有機弱酸或弱堿，它們的共軛酸堿對具有不同結(jié)構(gòu)而呈現(xiàn)不同顏色。當溶液的pH改變時，指示劑得到質(zhì)子，由堿式轉(zhuǎn)變?yōu)楣曹椝崾?，或失去質(zhì)子，由酸式轉(zhuǎn)變?yōu)楣曹棄A式，由于其結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變而發(fā)生顏色的變化。
進入核酸分子，形成異常RNA或DNA，影響核酸的功能并導(dǎo)致突變。5-氟尿嘧啶類似尿嘧啶，可進入RNA，與腺嘌呤配對或異構(gòu)成烯醇式與鳥嘌呤配對，使A-T對轉(zhuǎn)變?yōu)镚-C對。因為正常細胞可將其分解，而癌細胞不能，所以可選擇性抑制癌細胞生長。
